Au Moyen-Age, la Chapelle fait partie de la juridiction royale et occupe une situation stratégique encadrée d'un réseau de routes donnant accès aux Cévennes, Nîmes et le Rhône.

En 1839, la famille des Comtes de Voguës fit construire un tombeau dans son sol, où trois membres de cette famille sont inhumés. Ses restaurations, reconnaissables à la taille des pierres, datent de 1543, 1839 et 1872. Jusque dans les années 1950, on y vint prier St-Martin pour la guérison de la teigne infantile, ce qui la maintint dans un bon état relatif. Le 22 Mars 1976, M. le Marquis Pierre de Voguës cède à la commune de Tresques, la Chapelle et l'olivette.

Au début des années 1980, des vitraux contemporains ont été posés. La Chapelle est classée, en 1982, monument historique. Sa restauration est entreprise en 1990.